W przypadkach tzw. zimnej gruźlicy prosówkowej rozpoznanie różnicowe wymaga bardzo wnikliwej analizy i szeregu badań dodatkowych, a czasem nawet biopsji płuc.
Gruźlicze zapalenie opon mózgowo-rdzeniowych i mózgu (g.z.o.m. i m.) Wśród ostrych krwiopochodnych postaci gruźlicy pierwotnej g.z.o.m. i m. zajmuje wyjątkowe miejsce ze względu na ciężkość choroby, jeszcze dziś stosunkowo dużą śmiertelność i możliwość tiwałych uszkodzeń neurologicznopsychicznych. O powodzeniu leczenia bez trwałych uszkodzeń decyduje wczesne rozpoznanie i prawidłowość leczenia.